營業人所屬員工使用自有車輛從事與業務相關工作，如雙方書面約定車輛加油費及修理費由營業人負擔，該項費用支付的進項稅額可由營業人申報扣抵銷項稅額。

財政部高雄國稅局說明，依財政部78年9月11日台財稅第780273399號函及88年3月11日台財稅第881902028號函釋規定，員工於在職期間因業務需要使用自有車輛從事營業人之工作，如經書面約定油料費及修理費由營業人負擔，並取得符合加值型及非加值型營業稅法第33條規定載有營業人名稱、地址、統一編號及營業稅額的進項憑證（進項憑證屬三聯式統一發票者，依統一發票使用辦法第9條規定，得免記載買受人地址），其進項稅額非屬同法第19條規定不得扣抵銷項稅額之範圍，准予扣抵銷項稅額。

該局舉例說明，公司員工以自有車輛為公司從事與營業相關的運送工作，支付車輛維修費用及加油費用計新臺幣（下同）21,000元（費用金額20,000元及進項稅額1,000元），勞資雙方書面約定該費用由公司負擔，且該進項三聯式統一發票已載明公司名稱、統一編號及營業稅額1,000元等應記載事項，該進項稅額即可申報扣抵銷項稅額。

該局補充說明，營業人如有將非因業務所需支付員工車輛的維修費用及加油費用取得的進項憑證誤申報扣抵銷項稅額的情形，在未經檢舉、未經稅捐稽徵機關或財政部指定的調查人員進行調查前，請儘速向所轄稅捐稽徵機關自動補報並加計利息補繳稅額，依稅捐稽徵法第48條之1規定免罰。民眾如有相關疑義，可撥打免費服務電話0800-000-321洽詢，或至該局網站（https://www.ntbk.gov.tw）利用國稅智慧客服「國稅小幫手」線上查詢。