每年5月份辦理綜合所得稅結算申報時，如納稅義務人本人、配偶或受扶養親屬有給付合於規定醫療院所之醫藥及生育費，可自綜合所得總額中列舉扣除，但以未受有保險給付者為限。

有醫藥及生育費支出，且受有保險給付，因該項保險給付依所得稅法第4條第1項第7款規定免納所得稅，如再准予列舉扣除，顯屬重複，有違課稅公平原則。又民眾向保險公司申請保險理賠，投保商品不論是須檢附醫療單據的實支實付型，或按住院日數、依投保內容的定額型(日額型)，均以彌補被保險人因疾病住院及醫療所支付的費用為目的，因此，受有保險給付的醫藥及生育費不能再自綜合所得總額中列舉扣除。

舉例，陳君申報109年度綜合所得稅時，列報醫藥及生育費扣除額64萬元，但經國稅局查得陳君領有保險給付130萬元(實支實付型34萬元及定額型96萬元)，陳君主張應僅減除實支實付型的34萬元保險給付，餘30萬元仍可申報醫藥及生育費扣除，惟因陳君的支出均已受彌補，該局乃否准其認列。

納稅義務人申報列舉扣除醫藥及生育費時，除須確認屬醫療性質及符合所得稅法第17條規定的醫療院所外，如已受領保險給付，則不能再申報扣除。